顆粒有機肥作為云南有機肥的一種，主要經過肥料造粒等生產工藝，制成顆粒狀的有機肥料。與粉狀的有機肥相比不易結塊、在土壤中能夠充分快速溶解、肥料效力緩慢釋放、并被植物吸收。顆粒有機肥含有大量的營養物質，在施用的時候也要注意方法，方法不對也會造成植物燒根的情況。

顆粒有機肥用多了會燒根，如果有機肥施多了，會導致土壤因為濃度過高而燒根。正常情況下，植物根細胞液的濃度是大于土壤中濃度，當施肥過多時土壤濃度高于細胞液時，會導致根細胞細胞中的水滲出細胞，植物長期無法吸收水分就會燒根、燒苗。

如果云南有機肥料濃度過高，土壤的水勢將低于根部的水勢。土壤水不僅不會進入根系，而且根部細胞的水也會回流。土壤中的離子濃度相對較高，超過了農作物的細胞。所以土壤液體的濃度過高會造成燒根。未降解的農場肥料攜帶大量微生物和寄生蟲卵。當噴灑在農田上時，其中一些會附著在農作物上并造成直接污染，有些則侵入土壤并造成間接污染。一旦進入土壤，高溫會燃燒幼苗。